MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	AAGTG	2	10	56	65	40 %	20 %	40 %	0 %	111074075
2	NC_008273	AAT	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
3	NC_008273	CAA	2	6	119	124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074075
4	NC_008273	ATCA	2	8	135	142	50 %	25 %	0 %	25 %	111074075
5	NC_008273	AGAACA	2	12	143	154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	111074075
6	NC_008273	A	7	7	154	160	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
7	NC_008273	A	8	8	166	173	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
8	NC_008273	ATTA	2	8	177	184	50 %	50 %	0 %	0 %	111074075
9	NC_008273	A	7	7	192	198	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
10	NC_008273	TAA	2	6	199	204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
11	NC_008273	AAC	2	6	210	215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074075
12	NC_008273	A	6	6	240	245	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
13	NC_008273	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
14	NC_008273	A	6	6	293	298	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
15	NC_008273	ATA	2	6	325	330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
16	NC_008273	ATT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074075
17	NC_008273	A	6	6	346	351	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
18	NC_008273	AAT	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
19	NC_008273	TGA	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074075
20	NC_008273	TTA	2	6	424	429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074075
21	NC_008273	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111074075
22	NC_008273	A	6	6	476	481	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
23	NC_008273	A	7	7	489	495	100 %	0 %	0 %	0 %	111074075
24	NC_008273	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074075
25	NC_008273	AGA	2	6	596	601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074075
26	NC_008273	GCA	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074075
27	NC_008273	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	111074076
28	NC_008273	CGC	3	9	715	723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111074076
29	NC_008273	AAG	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074076
30	NC_008273	T	6	6	756	761	0 %	100 %	0 %	0 %	111074076
31	NC_008273	CCA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074076
32	NC_008273	ATTTT	2	10	817	826	20 %	80 %	0 %	0 %	111074076
33	NC_008273	TCA	2	6	831	836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074076
34	NC_008273	GTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074076
35	NC_008273	T	8	8	896	903	0 %	100 %	0 %	0 %	111074076
36	NC_008273	ATC	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074076
37	NC_008273	TCATTA	2	12	1029	1040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111074077
38	NC_008273	TTCC	2	8	1058	1065	0 %	50 %	0 %	50 %	111074077
39	NC_008273	T	7	7	1099	1105	0 %	100 %	0 %	0 %	111074077
40	NC_008273	ATTT	2	8	1134	1141	25 %	75 %	0 %	0 %	111074077
41	NC_008273	TTG	2	6	1172	1177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074077
42	NC_008273	TCA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074077
43	NC_008273	AT	3	6	1304	1309	50 %	50 %	0 %	0 %	111074077
44	NC_008273	T	6	6	1380	1385	0 %	100 %	0 %	0 %	111074078
45	NC_008273	ATTTCC	2	12	1395	1406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	111074078
46	NC_008273	A	6	6	1413	1418	100 %	0 %	0 %	0 %	111074078
47	NC_008273	TAA	2	6	1449	1454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074078
48	NC_008273	TAA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074078
49	NC_008273	T	6	6	1689	1694	0 %	100 %	0 %	0 %	111074079
50	NC_008273	TAG	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074079
51	NC_008273	ATA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074079
52	NC_008273	TCA	3	9	1862	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
53	NC_008273	AAGAT	2	10	1883	1892	60 %	20 %	20 %	0 %	111074079
54	NC_008273	T	6	6	2031	2036	0 %	100 %	0 %	0 %	111074079
55	NC_008273	ATC	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
56	NC_008273	TAGA	2	8	2079	2086	50 %	25 %	25 %	0 %	111074079
57	NC_008273	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074079
58	NC_008273	T	6	6	2193	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	111074079
59	NC_008273	TCA	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
60	NC_008273	T	7	7	2288	2294	0 %	100 %	0 %	0 %	111074079
61	NC_008273	TAC	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
62	NC_008273	CAT	2	6	2346	2351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
63	NC_008273	AGT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074079
64	NC_008273	ATT	3	9	2368	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074079
65	NC_008273	TCT	2	6	2417	2422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074079
66	NC_008273	TCA	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
67	NC_008273	TCT	3	9	2441	2449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074079
68	NC_008273	T	6	6	2623	2628	0 %	100 %	0 %	0 %	111074080
69	NC_008273	AAAT	2	8	2682	2689	75 %	25 %	0 %	0 %	111074080
70	NC_008273	GTA	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074080
71	NC_008273	GTTT	2	8	2698	2705	0 %	75 %	25 %	0 %	111074080
72	NC_008273	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074080
73	NC_008273	GTA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074080
74	NC_008273	A	6	6	2774	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	111074080
75	NC_008273	TCA	2	6	2804	2809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074080
76	NC_008273	A	6	6	2886	2891	100 %	0 %	0 %	0 %	111074080
77	NC_008273	AT	3	6	2921	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	111074080
78	NC_008273	T	6	6	3047	3052	0 %	100 %	0 %	0 %	111074080
79	NC_008273	A	6	6	3053	3058	100 %	0 %	0 %	0 %	111074080
80	NC_008273	TATCAA	2	12	3083	3094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111074081
81	NC_008273	AGT	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074081
82	NC_008273	ATC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074081
83	NC_008273	TTTG	2	8	3157	3164	0 %	75 %	25 %	0 %	111074081
84	NC_008273	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	111074081
85	NC_008273	AAT	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074081
86	NC_008273	AT	3	6	3330	3335	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
87	NC_008273	TACTT	2	10	3391	3400	20 %	60 %	0 %	20 %	111074081
88	NC_008273	GTTGA	2	10	3457	3466	20 %	40 %	40 %	0 %	111074081
89	NC_008273	GTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074081
90	NC_008273	GTT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074081
91	NC_008273	TTA	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074081
92	NC_008273	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074081
93	NC_008273	AT	4	8	3606	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
94	NC_008273	ATTAAG	2	12	3657	3668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111074081
95	NC_008273	GAA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074081
96	NC_008273	TTC	2	6	3717	3722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074081
97	NC_008273	AGC	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074081
98	NC_008273	ACC	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074081
99	NC_008273	A	7	7	3761	3767	100 %	0 %	0 %	0 %	111074081
100	NC_008273	ATTA	2	8	3780	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
101	NC_008273	TCT	2	6	3790	3795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074081
102	NC_008273	AGA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074081
103	NC_008273	AAT	2	6	3819	3824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074081
104	NC_008273	ATC	2	6	3846	3851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074081
105	NC_008273	A	8	8	3990	3997	100 %	0 %	0 %	0 %	111074082
106	NC_008273	AT	3	6	4000	4005	50 %	50 %	0 %	0 %	111074082
107	NC_008273	TTGTA	2	10	4019	4028	20 %	60 %	20 %	0 %	111074082
108	NC_008273	T	6	6	4083	4088	0 %	100 %	0 %	0 %	111074082
109	NC_008273	AGT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074082
110	NC_008273	ATAA	2	8	4191	4198	75 %	25 %	0 %	0 %	111074082
111	NC_008273	TTTTTG	2	12	4199	4210	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	111074082
112	NC_008273	CAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074082
113	NC_008273	TTA	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074082
114	NC_008273	ATT	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074082
115	NC_008273	TAC	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074083
116	NC_008273	ATA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074083
117	NC_008273	TTTC	2	8	4452	4459	0 %	75 %	0 %	25 %	111074083
118	NC_008273	GTT	2	6	4466	4471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074083
119	NC_008273	CTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074083
120	NC_008273	AAATT	2	10	4521	4530	60 %	40 %	0 %	0 %	111074083
121	NC_008273	TCT	2	6	4805	4810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074084
122	NC_008273	TCT	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074084
123	NC_008273	T	6	6	4899	4904	0 %	100 %	0 %	0 %	111074085
124	NC_008273	TGG	2	6	4981	4986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111074085
125	NC_008273	AT	3	6	5072	5077	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
126	NC_008273	CTT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074086
127	NC_008273	TCT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074086
128	NC_008273	TAAT	2	8	5183	5190	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
129	NC_008273	TTA	2	6	5238	5243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074086
130	NC_008273	TAT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074086
131	NC_008273	T	6	6	5435	5440	0 %	100 %	0 %	0 %	111074086
132	NC_008273	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074086
133	NC_008273	TAA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074086
134	NC_008273	T	6	6	5563	5568	0 %	100 %	0 %	0 %	111074086
135	NC_008273	T	6	6	5581	5586	0 %	100 %	0 %	0 %	111074086
136	NC_008273	ATA	2	6	5587	5592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074086
137	NC_008273	TGA	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074086
138	NC_008273	TCT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074086
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